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百香果连作对土壤细菌群落结构的影响(二)

发布时间:2021-07-31 11:57 编辑者:特邀作者夏德婷

2.2 稀释曲线与Alpha多样性分析

2.2.1稀释曲线

从图1(a)的Sobs 指数稀释曲线可知,随着测序数据量增加,Sobs 指数逐渐趋于平缓,说明测序数据量合理;Shannon多样性指数曲线随着样本测序数据的增加,最终趋于平坦(图1b),说明测序数据能反映样本中绝大多数的微生物多样性信息。

2.2.2 Alpha多样性分析

不同连作年限百香果土壤细菌多样性指数如表2所示,其Coverage指数表示样本的文库覆盖率,其数值越高,表示样本中序列被测出的概率越高,如表2所示,各样本Coverage指数均大于98%,说明各样本细菌基因序列被检出的概率较高,能较真实地反映样本的细菌群落;Ace和Chao指数反映细菌群落的丰富度程度,指数值越高,样本细菌丰富度越高;Shannon指数和Simpson指数反映样本中细菌群落的多样性程度,Shannon值越大,表明细菌多样性越高,Simpson指数值越大,表明细菌优势度越高,均匀性越低,多样性越低。各样本Ace、Chao、Shannon和Simpson指数差异显著(P<0.05),如表2所示,随着种植年限的增加,百香果种植土壤细菌的丰富度、多样性指数均呈先增加后降低的趋势,其中Ace和Chao指数在种植第二年时达到最大,Shannon多样性指数在连作第三年时达到峰值,Simpson指数在前三年逐渐降低,连作4年时与撂荒地相近。上述结果说明连作能显著影响百香果根区土壤细菌群落的多样性。

声明:本文所用图片、文字来源《热带作物学报》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。

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