北方伟业计量集团有限公司
以提取的枯草芽孢杆菌S7基因组为模板,根据飞行质谱结果获得的植物过氧化氢酶基因序列设计引物(见表2),PCR扩增从而获取目的基因片段。随后将载体pET-24a(+)与PCR产物分别与相对应的限制性内切酶混合,在37℃下孵育1.5h,两者酶切产物经过胶回收纯化后用DNA连接酶连接,在16℃下连接6~8h,连接产物通过热激法转化E.coliDH5α感受态细胞,在LB卡那霉素抗性平板上挑取阳性克隆子,菌落PCR验证后提取质粒,经过测序鉴定,最终获得含有目的基因的重组质粒pET-24a(+)/katA。将质粒pET-24a(+)/katA转化E.ColiBL21(DE3)感受态细胞,最终获得重组植物过氧化氢酶表达菌株。
纯化过程全部在4℃下进行,将离心收集的重组菌充分倒入培养基。将菌体重悬于25mL缓冲液A(200mmol/LTris-HCl(pH7.4),500mmol/LNaCl,5mmol/Lβ-mercaptoe-than01)中,使用BransonSonmer450对细胞进行了超声破壁处理,高速离心后收集破碎液上清液。再采用AKTAStart(GEHealthcare)和HisTraD亲和柱对目标蛋白质进行纯化,在经缓冲液A平衡后接入上清液,先使用含5mmol/L咪唑的缓冲液A进行清洗后,使用含300mmol/L咪唑的缓冲液A进行洗脱,获得重组植物过氧化氢酶。
水解产物经过超滤、脱盐等预处理后,直接加载到反相预柱(AcclaimPepMapRSLC)进行肽段分离,分离后肽段经QExactiveP1us混合四极轨道质谱仪分析,收集的串联质谱结果上传至mascot搜索引擎进行分析,比对后获得对应的肽段序列。
将筛选获得的野生菌进行16SrRNA和功能基因gyrA鉴定,以确定各个野生菌的种属,再分别进行发酵培养,获得其发酵液上清液。由于不同野生菌蛋白酶表达量不同,无法直接使用发酵液上清液进行横向比较。而0PA法可检测整个体系水解程度,ELISA可以检测水解反应体系中针对某一特定底物的水解程度,利用此特点设计实验,首先通过0PA法确定各个发酵液的酶活,再分别稀释,使其针对整体底物脱脂奶粉的酶活达到相同水平。此后,将调整浓度后的发酵液对脱脂奶粉进行水解反应,并通过ELISA分析对底物αs1酪蛋白的酶活。如此可筛选出对混合底物脱脂奶粉的酶活相同时,对过敏原αs1酪蛋白选择性更高的蛋白酶产生菌。如图2所示,横坐标为各个野生菌的种属名和筛选编号,纵坐标为调整后发酵液上清液的水解叱,酪蛋白酶活。其中酶活最高的为枯草芽孢杆菌S7发酵液上清液,而作为对照的商业酶A-2SD和NY-10酶活较低。在总酶活调整一致的情况下,其他野生菌针对过敏原酶活水平不高,如嗜麦芽寡养单胞菌S2、绿脓假单胞菌S8(非食品安全菌),故选择枯草芽孢杆菌S7为去除过敏原的主要研究对象,并进行菌种保藏(CCTCCN0.M2016532)。同时被鉴定为枯草芽孢杆菌的还有S21和S23,值得关注的是S21和S23酶活水平接近,但与S7有显著差异。
通过比对S7和S21的发酵液上清液进行SDS-PAGE分析发现,枯草芽孢杆菌S7在5.5×104位置分泌的一种蛋白质在S21发酵液中分泌量极少。此后使用MALDI-TOF/T0F对各个条带进行肽指纹图谱分析,如图3所示,以3.2×104的鞭毛蛋白(uniProtKB:P02968,含量最高条带)作为对比参照,主要蛋白酶为2.8×104的枯草芽孢杆菌蛋白酶E(UniProtKB:P04189),而表达量差异最大是5.5×104的植物过氧化氢酶(UniProtKB:P26901)。
通过从枯草芽孢杆菌S7中调取植物过氧化氢酶基因,并构建重组表达质粒,获得异源表达菌株。再通过诱导表达和镍柱亲和层析法,获得了重组植物过氧化氢酶。如图4中SDS-PAGE所示,泳道1为镍柱纯化流穿峰,泳道2为5mmol/L咪唑洗脱峰,泳道3为300mmol/L咪唑洗脱峰,在5.5×104左右可见明显条带,证明获得可融性表达的重组酶。
通过将纯化后的重组植物过氧化氢酶回补至S21发酵液上清液巾,S21水解αs1酪蛋白的酶活从75.43U/L提升至106.18U/L达到与S7的119.43U/L相近水平,从而证明了S7和S21的酶活差异主要是由植物过氧化氢酶的表达量差异导致的。据此,我们发现植物过氧化氢酶不仅可以水解过氧化氢,维持更好的还原环境,协助枯草芽孢杆菌蛋白酶E抵抗氧化应激,保护其结构不被自由基破坏,增加蛋白酶作用时间;可能还具有破坏蛋白胶粒中的二硫键,将其中的过敏原αs1酪蛋白释放出来,使蛋白酶可以更高效地进行水解反应,增强蛋白酶的选择性脱敏效果(见图5)。
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4种不同沼气工程模式的能值数据见表2。总能值投入量由可更新环境资源能值、不可更新环境资源能值、可更新有机能值和不可更新工业辅助能值组成,统计后的能值流分析结果见表3。
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